FlexS

ਵੇਰਵਾ

FlexS ਦੂਜੇ ਲਿਗਾਂਡਾਂ ਵਿੱਚੋਂ ਇੱਕ ਦੀ ਸੰਰਚਨਾ ਅਤੇ ਸਥਿਤੀ ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਦਾ ਹੈ। FlexS ਵਿੱਚ ਰੈਫਰੈਂਸ-ਲਿਗੈਂਡ ਨੂੰ ਕਠੋਰ ਮੰਨਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ, ਇਸਨੂੰ ਇੱਕ ਕੰਫਰਮੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਦਿੱਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਜੋ ਬਾਊਂਡ ਅਵਸਥਾ ਦੇ ਸਮਾਨ ਹੈ। FlexS ਵਿੱਚ ਸੁਪਰਪੁਜੀਸ਼ਨ ਐਲਗੋਰਿਦਮ ਲਈ ਸਿਰਫ ਥੋੜ੍ਹੇ ਜਿਹੇ ਹੱਥੀਂ ਦਖਲ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ। ਤੁਸੀਂ ਇਸ ਗਿਆਨ ਨੂੰ ਗਣਨਾ ਵਿੱਚ FlexS ਦੇ ਨਾਲ ਇੱਕਲੇ ਕਦਮਾਂ ਨੂੰ ਹੱਥੀਂ ਲੈ ਕੇ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹੋ। ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ, FlexS ਨੂੰ ligand ਜੋੜਿਆਂ 'ਤੇ ਇੰਟਰਐਕਟਿਵ ਕੰਮ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ligand-ਅਧਾਰਿਤ ਵਰਚੁਅਲ ਸਕ੍ਰੀਨਿੰਗ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ। FlexS ਦੀਆਂ ਦੋ ਮੁੱਖ ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ligand ਸੁਪਰ ਪੋਜੀਸ਼ਨਿੰਗ (ਉਦਾਹਰਨ ਲਈ CoMFA/QSAR ਲਈ) ਅਤੇ ਵਰਚੁਅਲ ਸਕ੍ਰੀਨਿੰਗ ਹਨ। ਜੇਕਰ ਤੁਹਾਡੇ ਕੋਲ ਇੱਕ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਅਤੇ ਇੱਕ ਛੋਟਾ ਅਣੂ ਇਸ ਨਾਲ ਬਾਈਡਿੰਗ ਹੈ (ਅਖੌਤੀ ਹਵਾਲਾ-ਲਿਗੈਂਡ) ਪਰ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਦੀ ਕੋਈ ਬਣਤਰ ਨਹੀਂ ਹੈ, ਤਾਂ ਤੁਸੀਂ ਸੰਦਰਭ ਬਣਤਰ ਨੂੰ ਕਿਰਿਆਸ਼ੀਲ ਸਾਈਟ ਦੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਫਿੰਗਰਪ੍ਰਿੰਟ ਵਜੋਂ ਲੈ ਸਕਦੇ ਹੋ। FlexS ਉਹਨਾਂ ਨੂੰ ਇਕਸਾਰ ਕਰਕੇ ਟੈਸਟ ਅਤੇ ਸੰਦਰਭ ਢਾਂਚੇ ਵਿਚਕਾਰ ਸਮਾਨਤਾ ਨਿਰਧਾਰਤ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਵਰਚੁਅਲ ਸਕ੍ਰੀਨਿੰਗ ਵਿੱਚ, ਤੁਹਾਡੇ ਕੋਲ ਇੱਕ ਹਵਾਲਾ-ਲਿਗੈਂਡ ਅਤੇ ਮਿਸ਼ਰਣਾਂ ਦਾ ਇੱਕ ਸਮੂਹ ਹੈ ਅਤੇ ਤੁਸੀਂ ਪ੍ਰਯੋਗਾਤਮਕ ਜਾਂਚ ਲਈ ਮਿਸ਼ਰਣਾਂ ਨੂੰ ਤਰਜੀਹ ਦੇਣ ਵਿੱਚ ਦਿਲਚਸਪੀ ਰੱਖਦੇ ਹੋ।